MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB01

Total Repeats: 401

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017180	ACAA	2	8	8	15	75 %	0 %	0 %	25 %	384410830
2	NC_017180	CTCA	2	8	70	77	25 %	25 %	0 %	50 %	384410830
3	NC_017180	GAT	2	6	78	83	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410830
4	NC_017180	ATT	2	6	144	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410830
5	NC_017180	TTG	3	9	328	336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410830
6	NC_017180	ATA	2	6	339	344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410830
7	NC_017180	GAA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410830
8	NC_017180	T	6	6	371	376	0 %	100 %	0 %	0 %	384410830
9	NC_017180	ATG	2	6	395	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410831
10	NC_017180	ATC	2	6	434	439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410831
11	NC_017180	ATT	2	6	516	521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410831
12	NC_017180	GAG	2	6	548	553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410831
13	NC_017180	CT	3	6	555	560	0 %	50 %	0 %	50 %	384410831
14	NC_017180	GAA	2	6	563	568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410831
15	NC_017180	TTAT	2	8	569	576	25 %	75 %	0 %	0 %	384410831
16	NC_017180	A	7	7	585	591	100 %	0 %	0 %	0 %	384410831
17	NC_017180	TTG	2	6	627	632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410831
18	NC_017180	GAC	2	6	647	652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410831
19	NC_017180	ATA	2	6	665	670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410831
20	NC_017180	TGT	2	6	682	687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410831
21	NC_017180	A	6	6	693	698	100 %	0 %	0 %	0 %	384410831
22	NC_017180	AGG	2	6	910	915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410831
23	NC_017180	AAC	2	6	1074	1079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410831
24	NC_017180	CAAC	2	8	1109	1116	50 %	0 %	0 %	50 %	384410831
25	NC_017180	CGA	2	6	1204	1209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410831
26	NC_017180	CCG	2	6	1225	1230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410831
27	NC_017180	GTT	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410831
28	NC_017180	GAT	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410831
29	NC_017180	CCT	2	6	1445	1450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410831
30	NC_017180	TGT	2	6	1631	1636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410831
31	NC_017180	AGC	2	6	1651	1656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410831
32	NC_017180	T	7	7	1721	1727	0 %	100 %	0 %	0 %	384410831
33	NC_017180	CAA	2	6	1762	1767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410831
34	NC_017180	AAAGT	2	10	1797	1806	60 %	20 %	20 %	0 %	384410831
35	NC_017180	A	7	7	1844	1850	100 %	0 %	0 %	0 %	384410831
36	NC_017180	TTA	2	6	1851	1856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410831
37	NC_017180	CTT	2	6	1898	1903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410831
38	NC_017180	TCTG	2	8	1977	1984	0 %	50 %	25 %	25 %	384410832
39	NC_017180	TGCG	2	8	2120	2127	0 %	25 %	50 %	25 %	384410832
40	NC_017180	CTG	2	6	2179	2184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410832
41	NC_017180	AC	3	6	2201	2206	50 %	0 %	0 %	50 %	384410832
42	NC_017180	CCG	2	6	2226	2231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410832
43	NC_017180	GTG	2	6	2269	2274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410832
44	NC_017180	CA	3	6	2286	2291	50 %	0 %	0 %	50 %	384410832
45	NC_017180	AAT	2	6	2335	2340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410832
46	NC_017180	TCA	2	6	2411	2416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410832
47	NC_017180	GTG	2	6	2434	2439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410832
48	NC_017180	ACGCT	2	10	2465	2474	20 %	20 %	20 %	40 %	384410832
49	NC_017180	TCC	2	6	2518	2523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410832
50	NC_017180	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410832
51	NC_017180	GCCG	2	8	2590	2597	0 %	0 %	50 %	50 %	384410832
52	NC_017180	GAA	2	6	2739	2744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410832
53	NC_017180	TGCC	2	8	2787	2794	0 %	25 %	25 %	50 %	384410832
54	NC_017180	GGTG	2	8	2847	2854	0 %	25 %	75 %	0 %	384410832
55	NC_017180	CGCC	2	8	2916	2923	0 %	0 %	25 %	75 %	384410832
56	NC_017180	CAT	2	6	2946	2951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410832
57	NC_017180	GAC	2	6	2977	2982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410832
58	NC_017180	GC	3	6	3005	3010	0 %	0 %	50 %	50 %	384410832
59	NC_017180	GAC	2	6	3052	3057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410832
60	NC_017180	CTC	2	6	3067	3072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410832
61	NC_017180	ACC	2	6	3100	3105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410832
62	NC_017180	GACC	2	8	3153	3160	25 %	0 %	25 %	50 %	384410832
63	NC_017180	TGG	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410832
64	NC_017180	CCT	2	6	3290	3295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410832
65	NC_017180	AC	3	6	3338	3343	50 %	0 %	0 %	50 %	384410832
66	NC_017180	TATT	2	8	3414	3421	25 %	75 %	0 %	0 %	384410832
67	NC_017180	GCC	2	6	3428	3433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410832
68	NC_017180	TG	3	6	3676	3681	0 %	50 %	50 %	0 %	384410832
69	NC_017180	ATC	2	6	3697	3702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410832
70	NC_017180	TGA	3	9	3726	3734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410832
71	NC_017180	GGT	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410832
72	NC_017180	ACT	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410832
73	NC_017180	ACA	2	6	3854	3859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410832
74	NC_017180	ATGT	2	8	3931	3938	25 %	50 %	25 %	0 %	384410832
75	NC_017180	GGT	2	6	4012	4017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410832
76	NC_017180	TGG	2	6	4019	4024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410832
77	NC_017180	GGC	2	6	4056	4061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410832
78	NC_017180	TGA	2	6	4104	4109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410832
79	NC_017180	CAT	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410832
80	NC_017180	CAG	2	6	4273	4278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410832
81	NC_017180	TGA	2	6	4389	4394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410832
82	NC_017180	GGC	2	6	4440	4445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410832
83	NC_017180	AGCT	2	8	4499	4506	25 %	25 %	25 %	25 %	384410832
84	NC_017180	CTT	2	6	4608	4613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410832
85	NC_017180	GCT	2	6	4668	4673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410832
86	NC_017180	GAA	2	6	4867	4872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410832
87	NC_017180	AGG	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410832
88	NC_017180	CGC	2	6	5050	5055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410832
89	NC_017180	AGG	2	6	5142	5147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410832
90	NC_017180	TA	3	6	5148	5153	50 %	50 %	0 %	0 %	384410832
91	NC_017180	A	7	7	5752	5758	100 %	0 %	0 %	0 %	384410833
92	NC_017180	GAG	2	6	5769	5774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410833
93	NC_017180	T	6	6	5862	5867	0 %	100 %	0 %	0 %	384410833
94	NC_017180	TAT	2	6	5928	5933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410833
95	NC_017180	GTAA	2	8	5991	5998	50 %	25 %	25 %	0 %	384410833
96	NC_017180	GCA	2	6	6023	6028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410833
97	NC_017180	GTT	3	9	6053	6061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410833
98	NC_017180	GTT	2	6	6072	6077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410833
99	NC_017180	GGCAA	2	10	6094	6103	40 %	0 %	40 %	20 %	384410833
100	NC_017180	TTA	2	6	6173	6178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410833
101	NC_017180	T	6	6	6195	6200	0 %	100 %	0 %	0 %	384410833
102	NC_017180	ATA	2	6	6223	6228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410833
103	NC_017180	TCA	2	6	6233	6238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410833
104	NC_017180	AAT	2	6	6281	6286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410833
105	NC_017180	AT	3	6	6291	6296	50 %	50 %	0 %	0 %	384410833
106	NC_017180	ATT	2	6	6316	6321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410833
107	NC_017180	ATAA	3	12	6330	6341	75 %	25 %	0 %	0 %	384410833
108	NC_017180	T	6	6	6395	6400	0 %	100 %	0 %	0 %	384410833
109	NC_017180	AAT	2	6	6475	6480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410833
110	NC_017180	CAG	2	6	6501	6506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410833
111	NC_017180	TCT	2	6	6605	6610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410833
112	NC_017180	GC	3	6	6652	6657	0 %	0 %	50 %	50 %	384410833
113	NC_017180	T	6	6	6680	6685	0 %	100 %	0 %	0 %	384410833
114	NC_017180	A	6	6	6752	6757	100 %	0 %	0 %	0 %	384410833
115	NC_017180	ATA	2	6	6767	6772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410833
116	NC_017180	AAATG	2	10	6965	6974	60 %	20 %	20 %	0 %	384410834
117	NC_017180	TAT	2	6	6987	6992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410834
118	NC_017180	GAA	2	6	6999	7004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410834
119	NC_017180	TAT	2	6	7005	7010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410834
120	NC_017180	TGT	2	6	7071	7076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410834
121	NC_017180	GCA	2	6	7081	7086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410834
122	NC_017180	A	8	8	7088	7095	100 %	0 %	0 %	0 %	384410834
123	NC_017180	ATA	2	6	7142	7147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410834
124	NC_017180	ATA	2	6	7166	7171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410834
125	NC_017180	AGGC	2	8	7213	7220	25 %	0 %	50 %	25 %	384410834
126	NC_017180	GC	3	6	7219	7224	0 %	0 %	50 %	50 %	384410834
127	NC_017180	ATG	2	6	7343	7348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410834
128	NC_017180	AGA	2	6	7533	7538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410834
129	NC_017180	ATT	2	6	7588	7593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410834
130	NC_017180	A	8	8	7596	7603	100 %	0 %	0 %	0 %	384410834
131	NC_017180	TAA	2	6	7605	7610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410834
132	NC_017180	TGG	2	6	7686	7691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410834
133	NC_017180	TCTT	2	8	7692	7699	0 %	75 %	0 %	25 %	384410834
134	NC_017180	A	6	6	7704	7709	100 %	0 %	0 %	0 %	384410834
135	NC_017180	ATC	2	6	7772	7777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410834
136	NC_017180	CTT	2	6	7811	7816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410834
137	NC_017180	TA	3	6	7817	7822	50 %	50 %	0 %	0 %	384410834
138	NC_017180	GAAA	2	8	7872	7879	75 %	0 %	25 %	0 %	384410834
139	NC_017180	CG	3	6	7880	7885	0 %	0 %	50 %	50 %	384410834
140	NC_017180	TAA	2	6	7943	7948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410834
141	NC_017180	GTCA	2	8	7961	7968	25 %	25 %	25 %	25 %	384410834
142	NC_017180	CTAT	2	8	8009	8016	25 %	50 %	0 %	25 %	384410834
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146	NC_017180	CGT	2	6	8200	8205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410834
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158	NC_017180	CCTCT	2	10	8771	8780	0 %	40 %	0 %	60 %	384410834
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164	NC_017180	TGC	2	6	9165	9170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410834
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171	NC_017180	AAT	3	9	9502	9510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410834
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243	NC_017180	TTC	2	6	16196	16201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410843
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246	NC_017180	A	6	6	16304	16309	100 %	0 %	0 %	0 %	384410843
247	NC_017180	CAA	2	6	16392	16397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410843
248	NC_017180	CTG	2	6	16453	16458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410843
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250	NC_017180	CATG	2	8	16599	16606	25 %	25 %	25 %	25 %	384410843
251	NC_017180	TGA	2	6	16851	16856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410844
252	NC_017180	AAAT	2	8	16858	16865	75 %	25 %	0 %	0 %	384410844
253	NC_017180	CG	3	6	16932	16937	0 %	0 %	50 %	50 %	384410844
254	NC_017180	TGTCT	2	10	16942	16951	0 %	60 %	20 %	20 %	384410844
255	NC_017180	TAA	2	6	16996	17001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410844
256	NC_017180	GCGGT	2	10	17005	17014	0 %	20 %	60 %	20 %	384410844
257	NC_017180	TCAT	2	8	17036	17043	25 %	50 %	0 %	25 %	384410844
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259	NC_017180	T	6	6	17066	17071	0 %	100 %	0 %	0 %	384410844
260	NC_017180	AGA	2	6	17185	17190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410845
261	NC_017180	TCG	2	6	17267	17272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410845
262	NC_017180	AGA	2	6	17276	17281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410845
263	NC_017180	T	6	6	17446	17451	0 %	100 %	0 %	0 %	384410846
264	NC_017180	CTGTT	2	10	17476	17485	0 %	60 %	20 %	20 %	384410846
265	NC_017180	TCT	2	6	17539	17544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410846
266	NC_017180	GA	3	6	17550	17555	50 %	0 %	50 %	0 %	384410846
267	NC_017180	CTGA	2	8	17590	17597	25 %	25 %	25 %	25 %	384410847
268	NC_017180	GAA	3	9	17623	17631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410847
269	NC_017180	AAG	2	6	17698	17703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410847
270	NC_017180	CTT	2	6	17931	17936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410848
271	NC_017180	CAT	2	6	17937	17942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410848
272	NC_017180	TTCT	2	8	18039	18046	0 %	75 %	0 %	25 %	384410848
273	NC_017180	AAT	2	6	18139	18144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410848
274	NC_017180	CGA	2	6	18322	18327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410848
275	NC_017180	CCG	2	6	18451	18456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410848
276	NC_017180	TCT	2	6	18613	18618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410848
277	NC_017180	GTC	2	6	18713	18718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410848
278	NC_017180	TAC	2	6	18723	18728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410848
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280	NC_017180	CGC	2	6	18803	18808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410848
281	NC_017180	CTT	2	6	18832	18837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410848
282	NC_017180	GAAA	2	8	18994	19001	75 %	0 %	25 %	0 %	384410848
283	NC_017180	AAG	2	6	19086	19091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410848
284	NC_017180	AAG	2	6	19100	19105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410848
285	NC_017180	AGG	2	6	19155	19160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410848
286	NC_017180	A	6	6	19168	19173	100 %	0 %	0 %	0 %	384410848
287	NC_017180	TTAT	2	8	19231	19238	25 %	75 %	0 %	0 %	384410848
288	NC_017180	ATA	2	6	19239	19244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410848
289	NC_017180	ACG	2	6	19245	19250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410848
290	NC_017180	AGA	2	6	19270	19275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410848
291	NC_017180	GTT	2	6	19319	19324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410848
292	NC_017180	ACCTGA	2	12	19336	19347	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384410848
293	NC_017180	GCT	2	6	19397	19402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410848
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295	NC_017180	CCT	2	6	19471	19476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410848
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297	NC_017180	CTG	2	6	19708	19713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410849
298	NC_017180	TCAA	2	8	19731	19738	50 %	25 %	0 %	25 %	384410849
299	NC_017180	GCA	2	6	19810	19815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410849
300	NC_017180	AGTTC	2	10	19963	19972	20 %	40 %	20 %	20 %	384410849
301	NC_017180	CAA	2	6	20004	20009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410849
302	NC_017180	CATA	2	8	20193	20200	50 %	25 %	0 %	25 %	384410849
303	NC_017180	ATC	2	6	20219	20224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410849
304	NC_017180	ATCTT	2	10	20298	20307	20 %	60 %	0 %	20 %	384410849
305	NC_017180	TGC	2	6	20688	20693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410850
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309	NC_017180	TA	3	6	22096	22101	50 %	50 %	0 %	0 %	384410851
310	NC_017180	ATC	2	6	22174	22179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410851
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341	NC_017180	CGA	2	6	24023	24028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410853
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372	NC_017180	T	6	6	28295	28300	0 %	100 %	0 %	0 %	384410855
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375	NC_017180	ATT	2	6	30487	30492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410856
376	NC_017180	TCA	2	6	30501	30506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410856
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380	NC_017180	CAG	2	6	30974	30979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410857
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384	NC_017180	TGA	2	6	31234	31239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410857
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386	NC_017180	GAC	2	6	31379	31384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410857
387	NC_017180	GGGTC	2	10	31402	31411	0 %	20 %	60 %	20 %	384410857
388	NC_017180	ACGC	2	8	31489	31496	25 %	0 %	25 %	50 %	384410857
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391	NC_017180	TGG	2	6	31793	31798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410857
392	NC_017180	CAG	2	6	31845	31850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410857
393	NC_017180	GTG	2	6	31916	31921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410857
394	NC_017180	CGC	2	6	31970	31975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410857
395	NC_017180	TGG	2	6	31980	31985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410857
396	NC_017180	TGT	2	6	31993	31998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410857
397	NC_017180	T	6	6	32028	32033	0 %	100 %	0 %	0 %	384410857
398	NC_017180	GCCT	2	8	32051	32058	0 %	25 %	25 %	50 %	384410857
399	NC_017180	AAG	2	6	32078	32083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410857
400	NC_017180	CCG	2	6	32161	32166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410857
401	NC_017180	GAA	2	6	32345	32350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410857

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.